Popularne

Komunikat pyłkowy

Kraków, na dzień: 13.07.2025 r.

takson	stężenie	prognoza

Sprawdź szczegóły

Komunikat opracowany przez Krakowską Stację Monitoringu Aerobiologicznego przy Zakładzie Alergologii Klinicznej i Środowiskowej UJCM.

stężenie
niskie	średnie
wysokie	bardzo wysokie

Komunikat pyłkowy

Kraków, na dzień: 13.07.2025 r.

takson	stężenie	prognoza

Sprawdź szczegóły

Komunikat opracowany przez Krakowską Stację Monitoringu Aerobiologicznego przy Zakładzie Alergologii Klinicznej i Środowiskowej UJCM.

stężenie
niskie	średnie
wysokie	bardzo wysokie

Jakość powietrza

OmicsON – Integration of omics data with molecular networks and statisticalprocedures.

potrzeba opisu ich związku metodami teoretycznymi powoduje rozwój metod integracji danych. W artykule przedstawiono analizę danych omicznych poprzez integrację wiedzy biologicznej z procedurami matematycznymi zaimplementowanymi w bibliotece OmicsON programu R. OmicsON to narzędzie do integracji dwóch zestawów danych: transkryptomicznych i metabolomicznych. W procedurze analitycznej stosuje się grupowanie funkcjonalne i analizę statystyczną.

Podgrupy zbiorów danych transkryptomicznych i metabolomicznych tworzone są na podstawie wiedzy biologicznej przechowywanej w bazach danych Reactome i String. Dzięki zabiegowi zawężania danych w oparciu o wiedze biologiczną istnieje możliwość analizy takich zbiorów za pomocą wielowymiarowych procedur statystycznych, takich jak analiza korelacji kanonicznej (CCA) lub częściowa najmniejszych kwadratów (PLS). Integracja danych metabolomicznych i transkryptomicznych w oparciu o metodologię zawartą w OmicsON pozwala w łatwy sposób uzyskać informacje o powiązaniu tych danych. Informacje te mogą znacząco pomóc w ocenie zależności między ekspresją genów a stężeniami metabolitów, co z kolei ułatwia biologiczną interpretację analizowanych procesów biologicznych.

18 lipca 2020